题主您好，我想这个问题我是有发言权的。
在我而言，在正确的中医经络腧穴理论指导下，做针灸是可以的。
对于题主您提到的问题——“经常做针灸对穴位或身体有害吗？”我有一些问题还需要明确一下。
是“经常”二字。我在自己身上扎过的针没有20盒也有10盒了，一盒针有100根，也就是我自己在自己身上亲身实验的针超过1000根，我到现在学中医四年，第1年刚开始学医，没有扎过针，从第二年开始在自己身上扎针，也就是3年给自己扎了1000多根针，平均下来，差不多每天都要给自己扎1针。
当然，在给自己扎针时，是不会每天只给自己扎一针的。一般是一次扎多针，连续扎个几天，来调节身体，且或多或少均有效果，相比没有扎过针的人来说，我应该是比较经常扎针的了，所以我觉得适当扎针对身体是有利的。
至于艾灸，自从学了中医，我会在每年的夏秋之交，也就是十月初连续给自己艾灸足三里，每天灸大约30分钟，连着灸15天（只在天气晴朗时艾灸），今年是第二年，自我感觉脾胃功能比以前要好很多。其它时候则会在身体不舒服时给自己艾灸，比如夏天贪凉腹泻时给自己艾灸天枢穴，一般我自己一次灸30分钟就可以止泻了。
可如果题主的“经常”是每天都要扎针或艾灸且连续扎几年或艾灸几年，那么对身体和穴位是否有害，我就不得而知了。
我认为针灸既然能被用作一种医疗手段，说明在人产生病痛时，合适的针灸是可以帮助病人减轻痛苦，提高生活质量的。但是我建议做针灸的朋友还是在专业人员的指导下操作，切勿盲从。
下面附一张我给自己扎针的图片，献丑了。