艾灸能治疗身体大部分疾病。但，也有些病不适合艾灸。
艾灸疏经活络，对整个身体的调理起到一定的作用，采用不同的艾灸疗法，不仅防病保健，还可以起到美容养颜、延年益寿、养心安神等养生的作用。可根据疾病情况，人体素质和脏腑功能能偏盛偏衰，以补偏救弊的原则，各有重点的择优使用。常用健康养生灸，既无多大痛苦，又经济节约，长期坚持施灸，可提高身体素质，增进健康，其效果绝对不亚于服用保健品，是目前安全，行之有效的保健养生方法之一。
艾灸是通过经络体表直接给予人体温阳功效。艾灸生热，适量的热刺激适于适当的穴位便产生治病效应。在绝大多数情况下，实证、虚证、寒证在患者体表可以出现一些嗜热性。艾灸的温热刺激，使局部皮肤充血，毛细血管扩张，增强局部血液循环与淋巴循环，缓解消除平滑肌痉挛，使局部皮肤组织的代谢功能增强，促使炎症、粘连、渗出物、血肿等病理产物消散吸收，还可以降低神经系统的兴奋性，发挥镇静、镇痛作用。同时。温热作用还能促进药物吸收。
“不治已病，治未病”。体检对找到未病有帮助，但是体检并不是万能的，体检能查出血压、血糖高不高，骨密度是不是降低了，却查不出来体内是不是有寒邪或者暑湿等病邪，是把破坏健康的元凶找出来。中医认为，人是一个统一的整体，穴位是纵行人体之上的经络的点，刺激任何一个部位都可以引起人体全身的反应，刺激穴位也能引起本经络的反应，经络是气血的通路。艾灸治病是活用了其通经络的作用。
使用艾灸治疗疾病的人很多，但每个用过的人感觉都不一样。有的人感觉明显，见效很快，有的人见效就很慢。灸感的强弱一般代表了经络的阻塞程度。有灸感、灸感强，说明自身的经络通畅，作用立竿见影；没有灸感也不是没有效果，而是表示经络中邪气淤积严重，需要一点时间开瘀散阻，作用慢一些。
人的抵抗力强，疾病就不易产生。艾灸通过对某些穴位如大椎穴、足三里穴、气海穴、关元穴等施灸，可以培扶人的正气，增强人防病治病的能力，艾灸不同穴位和部位可产生不同的补益作用。正是这样温阳补益，调和气血的作用，帮助人们达到防病治病，保健养生的目的。
艾灸一般多适用于虚证、寒证、阴证。对于阴虚阳亢和邪热内炽的病人不宜使用灸法，如阴虚火旺的结合病；妊娠期妇女的小腹部、腰骶部不宜施灸；心脏、重要器官附近，毛发处等亦不宜施灸。
根据历代文献记载，人体全身有50余个穴位禁灸，如风府、人迎、承泣、迎香、素髎、石门等。