药物治疗是小儿治疗疾病的主要方法之一。由于小儿用药有其特殊性，从而要求在药物的品种选择、剂量、剂型、规格、用法等方面作出比成人更细致的、全面的考虑。
在用药前首先要明确诊断，查明病因对症下药，选择合适的药物，合理的使用。比如在抗生素的使用上，还存在很多问题。如对小儿的非感染性疾病、普通病毒性感冒、单纯性腹泻、肠痉挛导致腹痛、长期的过敏性咳嗽等，都选用抗生素治疗。甚至盲目动用高级的抗生素进行治疗，在经济负担加重的同时，还增加细菌的耐药性，长期应用还会导致肠道菌群失调，继发真菌感染。
因此，当小儿出现疾病时，不要急于用抗生素治疗，可根据病史、临床症状、结合必要的辅助检查，如血、尿、粪及胸片等常规检查，或选择一些特殊检查，寻找病原，初步确定是病毒、细菌还是支原体感染。一旦确定病因，对症下药，可避免盲目用药。
当初步确定病原或病因时，可选用合适的药物，选用药物须根据药物的特点，结合小儿的具体情况，选用安全、有效、可靠、价廉、易得的药物。不能用疗效不确切的药物。
在选择合适的药物后，要正确计算小儿用药量，绝不能以“差不多”、“大概多少”用药，药量不准，不是难以奏效，就是容易引起药物过量而产生不良反应。
要掌握影响药物的因素，如药物剂型、给药途径、小儿年龄、性别、营养状况及精神状态等，用药尽量少而精，排除各种可能出现的干扰，以期达到预期的治疗效果。
在儿童疾病药物治疗时，切忌随意滥用成人药，因为儿童的肝、肾、神经等器官、组织发育不完善，很容易受到损害或发生中毒反应。
小儿用药时，要严密观察病情的变化及治疗中的药物反应因为小儿具有病情变化快的特点，要随时决定继续用药或调整用药或调整剂量，使用药更趋合理，减少或避免药源性疾病的发生。
总之，小儿疾病的药物治疗，有其年龄特点，用药应该慎重合理的选择。在药物可用可不用的情况下尽量选择不用，能用一种药物可解决问题的就不要用两种以上的药物，能用口服药物的就不要打针，可用肌内注射药物的就不要用静脉滴注，能用局部用药的就不要全身用药，能用普通抗菌素的就不要用高级的抗菌素。
下面主要是讲如何选择用药剂量
根据儿童药代动力学及对药物的敏感性方面的特点，儿童用药剂量应较成人更为准确，但由于缺乏适用于儿童的药品规格，有些药品说明书中也没有标明儿童的用药剂量，因此需要计算儿童用药剂量，儿科用药剂量可按以下方法计算。
根据儿童年龄计算
①Fried公式：
婴儿药物剂量＝月龄×成人剂量/150。
②Young公式：
小儿药物剂量＝（年龄×成人剂量）/（年龄＋12）。
③其他公式：
1岁以内儿童用量＝0.01×（月龄＋3）×成人剂量。
1岁以上儿童用量＝0.05×（月龄＋2）×成人剂量。
根据年龄计算用药剂量的方法不太实用，很少被儿科医师采用，但对某些剂量不需要十分精确的药物，如镇咳药、助消化药，仍可以按年龄计算。
根据儿童体重计算
①若已知儿童的每千克体重剂量：直接乘以体重即可得1日或1次剂量。
如口服氨苄西林，剂量标明为1日每千克体重20～80mg，分4次服用。如儿童体重为15kg，即为：（20～80）×15＝300～1200mg，分成4次，即为一次75～300mg。
②若不知儿童每千克体重剂量，可按下式计算：小儿剂量＝成人剂量×小儿体重（kg）/70。
③若不知道儿童的体重多少，可按下列公式计算：
1～6个月小儿体重（kg）＝月龄×0.6＋3。
7～12个月小儿体重（kg）＝月龄×0.5＋3。
1～10岁小儿体重（kg）＝年龄×2＋8。
如所得结果不是整数，为便于服药可稍做调整。用体重计算年长儿童的剂量时，为避免剂量过大，应选用剂量的下限。反之，对婴幼儿可选择剂量的上限以防药量偏低。
根据体表面积计算
按体表面积计算剂最为合理，适用于各个年龄阶段，包括新生儿及成人，即不论任何年龄，其每平方米体表面积的剂量是相同的。
对某些特殊的治疗药，如抗肿瘤药、抗生素、激素，应以体表面积计算。此种计算比较合理，但首先要计算儿童体表面积。
如体重≤30kg，小儿体表面积（m2）=（体重×0.035）＋0.1。
如体重＞30kg，小儿体表面积（m2）=（体重－30）×0.02＋1.05。
或用下表折算儿童体表面积。
儿童体重与体表面积粗略折算表：
体重（kg） 体表面积（㎡）
3 0.21
4 0.25
5 0.29
6 0.33
7 0.39
8 0.42
9 0.46
10 0.49
12 0.56
14 0.62
16 0.7
18 0.75
20 0.8
25 0.9
30 1.15
上表不适宜体重大于30kg的儿童，对10岁以上的儿童，每增加5kg体重，体表面积增加0.10m2，如体表面积（30kg）=1.15m2，体表面积（35kg）=1.25m2，体表面积（50kg）＝1.55m2，体表面积（70kg）=1.73m2。体重超过50kg时，则每增加10kg体重，体表面积增加0.10m2。
①若已知每平方米剂量，直接乘以个人的体表面积即可。
②若不知每平方米体表面积的剂量，可按下式计算：儿童剂量=成人剂量×儿童体表面积（m2）/1.73m2。
按成人剂量折算表计算
按下列年龄折算比例表折算，总的趋势是剂量偏小，然而较安全，下表可供参考。
儿童剂量按成人剂量折算表：
年龄 相当成人剂量的比例
初生～1个月 1/18～1/14
1个月～6个月 1/14～1/7
6个月～1岁 1/7～1/5
1～2岁 1/5～1/4
2～4岁 1/4～1/3
4～6岁 1/3～2/5
6～9岁 2/5～1/2
9～14岁 1/2～2/3
14～18岁 2/3～全量
采用上述任何方法计算的剂量，还必须与病儿具体情况相结合，才能得出比较确切的药物用量，如：
1、新生儿或小婴儿肾功能较差，一般药物剂量宜偏小。
2、对新生儿耐受较强的药物如苯巴比妥，则可适当增大用量。
3、重症患儿用药剂量宜比轻症患儿大。
4、须通过血脑屏障发挥作用的药物，如治疗化脓性脑膜炎的磺胺类药或青霉素类药物剂量也应相应增大。